湖南雅湘DNA亲子鉴定咨询中心 网站地图     鉴定新闻
湖南雅湘DNA亲子鉴定咨询咨询中心首页湖南DNA亲子鉴定咨询中心服务项目亲子鉴定咨询DNA鉴定相关知识司法亲子鉴定咨询个人亲子鉴定咨询申请流程亲子鉴定咨询DNA鉴定的采样方式湖南雅湘DNA亲子鉴定咨询中心收费标准湖南雅湘DNA亲子鉴定咨询中心联络方式衡阳亲子鉴定咨询中心衡阳DNA鉴定机构
衡阳亲子鉴定中心衡阳DNA鉴定机构-湖南雅湘DNA亲子鉴定咨询中心
亲子鉴定常见问题
何为亲子鉴定
司法亲子鉴定所需流程
DNA亲子鉴定需要几个人做
什么是个人亲子鉴定
为什么要选择个人亲子鉴定
亲子鉴定与DNA鉴定的区别
DNA亲子鉴定原理
亲子鉴定的常见用途
严格按照AABB和ISO17025的要求鉴定

DNA亲子鉴定新闻

GEO专题实践一:如何使用公共基因表达数据库GEO

发表日期:2019/5/21 来源:湖南雅湘亲子鉴定中心

长沙雅湘基因生物科技有限公司培训部伍鸿荣今天和大家瞎聊下GEO,特开设专题,让您从系统上对GEO有个认识。价值2980元的生物信息课程,我们免费不保留发出。可以这么说,通过学习,大家完全可以发表一篇2分左右SCI文章。大家可以加我微信报名:1478115560.

如果有感觉不对的地方,请各位老师批评。

NCBI提供和维护的世界上最大的基因表达信息数据库(主要是微阵列)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/


您不仅可以搜索感兴趣的表达数据集和基因谱,还可以免费下载原始数据。

GPL:微阵列芯片的平台类型

GSM:从一个微阵列芯片获得的样品 - 样品数据


GSE:系列 - 在一次实验中获得的一组GSM


GDS:DataSet-一组通过收集NCBI工作人员可以分析的数据进行重组的GSM


关于GEO条目(意思是GEO ID号码的前三个字母)

#####【实践1】使用GEO搜索感兴趣的微阵列实验数据集

如何使用NCBI GEO 1-搜索和获取微阵列数据-视频正在制作,详情加微信:1478115560 。

从屏幕右侧的“浏览内容”中选择“平台”。

将显示平台(微阵列类型)的列表屏幕,因此单击顶部的“查找平台”。

出现平台的搜索屏幕。为“制造商”选择“Affymetrix”,为“有机体”选择“智人”,然后单击“确定”。

显示Affymetrix人类微阵列搜索结果。您可以通过单击列标题按每个项目进行排序。在表格中心单击“Samples”或“Series”两次,按降序对已注册的实验数据进行排序。

[HG-U133_Plus_2]很明显,Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array是最注册的数据平台。

当点击系列号“3855”时,过滤器中显示“平台:GPL570”,仅显示使用“Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array”的实验数据。

这次,我们将搜索与酒精性肝炎相关的数据。在搜索窗口中输入“酒精性肝炎”,然后单击“搜索”。

GSE28619-我们发现了一个名为转录组分析的数据集识别Fn14,一种TNF超家族受体成员,作为酒精性肝炎的治疗靶点。通过单击左端的“GSE28619”,可以查看数据集的详细信息。

已显示GSE28619的页面。

单击页面底部“下载系列”中的“系列矩阵文件”,显示标准化数据的下载链接。

您可以从页面底部“补充文件”中的链接下载原始数据。

  1. 让我们搜索与您的研究主题接近或有趣的微阵列数据。
  2. 详情:

GEO专题实践一:如何使用公共基因表达数据库GEO

GEO专题实践二:如何使用基因表达数据分析工具GEO2R

GEO专题实践三:使用DAVID在生物学上解释GEO数据

GEO专题实践四:如何使用转录因子预测工具TFactSv


相关新闻:
返回  收藏此页 打印本页  关闭
DNA亲子鉴定 人民币1250元/人 ——鉴定过程绝对保密 专家热线:0734-2576075 15367984271
鉴定新闻   友情链接   网站地图   关于我们   企业文化   中心寄语   衡阳亲子鉴定   深圳亲子鉴定   福建亲子鉴定   江西亲子鉴定   湖南亲子鉴定   移民亲子鉴定

联系地址:湖南省长沙市岳麓区桐梓坡路172号湘腾城市广场2605室       版权所有©2005-2009 湖南雅湘DNA亲子鉴定咨询中心